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香港医学博物馆是香港一所以医学为主题的博物馆，位于香港岛中西区上环及半山区之间一带，成立于1996年，用文献及实物展品介绍香港开埠以来的医科学术的发展历史。
香港医学博物馆内主要陈列了多种不同之医疗用具、介绍香港医学卫生及护理工作、19世纪时香港鼠疫的情况及实验室展示、及中草药的介绍和展示。此外，香港医学博物馆内亦开设了展览厅介绍雅丽氏妙龄那打素医院及东华三院的历史。
香港医学博物馆前身是成立于1906年3月15日正式启用的香港细菌学检验所，以应付当时流行的鼠疫。检验所作为首个香港专为医学化验而设的机构，初时对流行细菌病患作专门研究，随后更坚负起疫苗培植的工作。在二次大战过后，检验所易名为香港病理检验所，以涵盖更大的工作范围。当“病理检验所”在1960年迁往西营盘，及疫苗制造的工作在1973年迁离后，这座建筑物便一直只作政府仓库的用途，直至1990年被香港政府宣布列为法定古迹，并在1996年3月16日重新开放，成为香港医学博物馆的馆址。
